O Museu da Fauna e Flora do ICMC foi criado em 2013, a partir do interesse em registrar e difundir as espécies existentes no campus da USP em São Carlos, em particular, na região do ICMC. Essa região contém uma grande parte da área arborizada da área 1 do campus, compondo um ambiente com espécies arbóreas de grande, médio e pequeno portes e um conjunto de pequenos animais e pássaros não catalogados.
Conciliando ações da Superintendência de Gestão Ambiental da USP, apoiadora do projeto, e da Comissão de Cultura e Extensão do ICMC, que aprovou a criação do Museu e enfatizou a importância da manutenção das áreas verdes e preservação das espécies que aqui se encontram, este é um espaço privilegiado para a convivência de comunidade da USP e de São Carlos.